Ścianę przewodu pokarmowego budują poniższe warstwy:
- Śluzówka, w której skład wchodzą tkanka nabłonkowa oraz znajdująca się tuż pod nią tkanka łączna. W warstwie tej znajduje się sporo komórek gruczołowych, które produkują śluz nawilżający przesuwający się wzdłuż przełyku kęs pokarmu. Na obszarze żołądka, a przede wszystkim jelit, śluzówka wykazuje mocne pofałdowanie.
- Łącznotkankowa błona podśluzowa - w swej strukturze zawiera ona sporo nerwów, naczyń krwionośnych a także limfatycznych.
- Warstwa mięśniowa - tworzą ją mięśnie gładkie, których pasma ułożone są w dwóch płaszczyznach: wzdłuż i w poprzek. Rytmiczne kurczenie się tych pasm pozwalają na przesuwanie treści pokarmowej wzdłuż przewodu pokarmowego. Skurcze te są przyczyną występowania tzw. ruchów perystaltycznych jelit.
- Najbardziej zewnętrzna błona tzw. surowicza - jej zadaniem jest podtrzymywanie i mocowanie całej konstrukcji w obrębie jamy brzusznej. W swej strukturze także posiada naczynia krwionośne.