Zmiany w zasobach wód śródlądowych zachodzą głównie pod wpływem działalności człowieka. Ingerowanie człowieka w naturalne środowisko spowodowało jego zubożenie w rzeki i jeziora, posiadające czystą wodę i naturalne otoczenie.
Największym wpływem na jakość wód odznacza się produkcja przemysłowa. Fabryki wykorzystują znaczne ilości wód a ponadto wprowadzają do nich różnorodne i toksyczne ścieki, szkodliwe dla wód i organizmów w nich żyjących. Rolnictwo, zwłaszcza poprzez proces spłukiwania z pól chemicznych środków ochrony roślin a wraz z tym złe stosowanie nawozów sztucznych bądź naturalnych w znacznym stopniu wpływają na zwiększenie stopnia zanieczyszczenia zbiorników wodnych.
Człowiek, gospodarując wodą we własnych gospodarstwach domowych nie zauważa, jak dużo wody jest przez niego wykorzystywane. Produkuje on znaczne ilości ścieków komunalnych, w których można wyróżnić wiele szczepów bakterii, związków organicznych czy stosowanych np. do zmywania naczyń szkodliwych dla środowiska różnorodnych środków chemicznych - detergentów. Zanieczyszczenie zbiorników wód powierzchniowych przejawia się często poprzez zjawisko eutrofizacji. Przebiega ono jako wzbogacanie wód w zbiornikach wodnych w pierwiastki, takie jak: azot (N) i fosfor (P) - są one najczęściej dostarczane do wód wraz z nieoczyszczonymi ściekami. Wraz ze zwiększeniem ilości składników pokarmowych w wodzie dochodzi do przyspieszenia rozmnażania się mikroorganizmów w tych środowiskach.
Antropogeniczna działalność w środowisku widoczna jest na każdym kroku w postaci uregulowanych koryt rzecznych, z brzegami pokrytymi betonem. Brak wzdłuż nich kompleksów naturalnej roślinności. Zbiorowiska lasów łęgowych nie są już tak często spotykane jak w dawnych czasach.
Szkodliwie na stan i jakość zbiorników wodnych wpływa również wykorzystywanie zbiorników wodnych w celach rekreacyjnych. W letniej porze roku w czasie wakacji wokół jezior lub stawów kłębią się plażowicze, kąpiący się i osoby uprawiające różnorodne dyscypliny sportów wodnych. Często i nad wyraz skutecznie zaśmiecają oni brzegi i plaże, pozostawiając tam swe odpadki, nierzadko śmieci te dostają się bezpośrednio do zbiorników wodnych. Ludność płoszy ptactwo wodne z ich naturalnych siedlisk oraz niszczy w znacznym stopniu zbiorowiska roślinności przybrzeżnej.
Można powiedzieć, że człowiek swą działalnością nierzadko niszczy i dewastuje środowisko. Wiele eksperymentów doprowadziło do stworzenia pewnego kierunku badań, którego celem jest krzyżowanie określonych gatunków ryb. Mają one dawać większe ilości mięsa, ale ich stworzenie może być zagładą dla innych gatunków zwierząt i roślin.
Ludność jednak coraz bardziej jest świadoma swego destrukcyjnego wpływu na środowisko zbiorników wodnych. Budowane są oczyszczalnie ścieków, prowadzone są działania w celu przywrócenia pierwotnego charakteru uregulowanym strumieniom oraz próby oczyszczania jezior.