Temperatura wody w Bałtyku ulega znacznym wahaniom. Podczas lata woda się do 18 °C a w okresie zimowym ulega obniżeniu do 0 °C i wtedy dość często tworzy się pokrywa lodowa. W pierwszej kolejności zamarzają najbardziej płytkie wody przybrzeżne, a następnie wody zatok zamkniętych. Zalew Szczeciński, Zalew Wiślany i Zatoka Pucka zamarzają nawet na kilka tygodni. Zatoka Północna i Zatoka Fińska zamarzają na kilka miesięcy.
Wody Bałtyku są znacznie mniej słone niż innych akwenów wodnych na świecie. Główną tego przyczyną jest duży dopływ rzek, które powodują wysładzanie wody, a także niewielkim parowaniem wynikającym z niskiej temperatury. Na skutek małego zasolenia, Bałtyk jest dość ubogi w rośliny i zwierzęta jakie licznie reprezentowane są w słonych morzach. Do najpospolitszych ryb występujących w akwenie Morza Bałtyckiego, należą flądry, szproty, śledzie i dorsze.
Wśród ptaków najliczniejszą grupę stanowią krzykliwe mewy śmieszki oraz ptaki przylatujące na zimę z północnych krajów. Co do ssaków - czasem przywędrują tu wieloryby. Bardzo popularne są małże, które zalegają plaże. Wśród roślin przeważają glony, z których najbardziej popularny jest morszczyn, oraz nieliczne rośliny kwiatowe.
W Bałtyku żyją ponadto trzy gatunki fok: foka szara (Halichoerus grypus), foka pospolita (Phoca vitulina) i foka obrączkowana (Phoca hispida). Wszystkie gatunki fok objęte są ścisłą ochroną. Liczniej występuje foka szara, natomiast pospolita i obrączkowana pojawiają się u naszych wybrzeży bardzo rzadko. Foka szara rodzi młode zarówno na brzegu morza jak i na lodzie. Lód wybiera w przypadku braku spokoju na brzegu. Pojedyncze osobniki fok można zauważyć przy ujściu Wisły (Mewia Łacha), a poza tym w Ryfie Mew (Rybitwia Mielizna) oraz na Cyplu Helskim.
