Wraz z intensywnym rozwojem przemysłu, człowiek coraz bardziej zanieczyszcza środowisko naturalne. Duża ilość ścieków i odpadów przemysłowych trafia do rzek a potem do mórz. Zanieczyszczeń jest tak dużo, że rzeki i zbiorniki wodne w zastraszającym tempie zatracają zdolność do samooczyszczania wód. Zanieczyszczenia to nie tylko ścieki ale także stosowane przez rolników środki ochrony roślin czy nawozy. W ten sposób zanieczyszczeniu ulega gleba. Środki te przedostają się najpierw do wód gruntowych a potem do innych cieków.
Skala degradacji hydrosfery jest bardzo duża, dalsze jej zanieczyszczanie może doprowadzić do katastrofy ekologicznej.
Zanieczyszczenia wód śródlądowych różnią się od zanieczyszczeń mórz. Pierwsze stanowią problem państw, drugie natomiast są problemem ogólnoświatowym. Zanieczyszczenia mórz pochodzą głównie z rzek i spływu powierzchniowego. Nie tylko wody lądowe stanowią źródło zanieczyszczeń, ponieważ duże ich ilości dostają się z powietrza i z bezpośredniej działalności człowieka na otwartym morzu. Ścieki komunalne, przemysłu spożywczego, ścieki radioaktywne, zanieczyszczenia ropopochodne, odpady zatapiane przez wojska, węglowodory chlorowane. Zanieczyszczenia mogą pochodzić także z wytwarzanej energii cieplnej, zatapiania przedmiotów stałych ( złom, statki z zawartością szkodliwą dla środowiska), zatapianie osadów dennych. Na dnie Bałtyku znajduje się co najmniej kilkadziesiąt tysięcy ton broni chemicznej, także iperyt. Zagrożenie niosą także okręty podwodne o napędzie atomowym. Największe zagrożenie wód występuje w strefach przybrzeżnych. Degradacja środowiska oceanów to przede wszystkim efekt działań człowieka w głębi lądów.
Zanieczyszczenia mogą pochodzić z różnych źródeł, możemy je podzielić na dwa rodzaje: chemiczne, a te z kolei na: organiczne- (białka, tłuszcze, węglowodany, żywice, ropa) oraz nieorganiczne (kwasy, zasady, kationy metali ciężkich). Inny podział dzieli je na zanieczyszczenia fizyczne (czyli właściwości wody, np. barwa, temperatura) oraz fizjologiczne (smak, zapach). Biologiczne zanieczyszczenia powodują bakterie, grzyby, wirusy, pierwotniaki. Wody podziemne mogą być wzbogacane przez substancje antropogeniczne, pochodzące z zanieczyszczenia powierzchni Ziemi i atmosfery, na przykład przez stosowanie środków ochrony roślin lub nawozów sztucznych. Zanieczyszczenia takie zmieniają skład chemiczny wody podziemnej.
Wszystkie rodzaje zanieczyszczeń są niebezpieczne dla człowieka ale także dla całego środowiska naturalnego. Musimy zadbać, aby na naszej planecie nigdy nie zabrakło czystej wody, dlatego też trzeba dbać i oczyszczać zasoby hydrosfery. Jednym ze sposobów, najprostszym ale niestety niewystarczającym jest samooczyszczenie wód. Oprócz tego istnieją takie metody jak: przesiewanie, koagulacja, sterylizacja, filtracja, natlenianie.