Pod względem trofii wyróżniamy 3 główne typy jezior:
-jeziora oligotroficzne - o bardzo małej żyzności i ubogim życiu biologicznym,
-jeziora eutroficzne - o dużej żyzności i bogatym życiu biologicznym
-jeziora dystroficzne - duża ilość rozpuszczonych substancji humusowych,
Eutrofizacja jest zjawiskiem naturalnym. Po ustąpieniu lądolodu wszystkie jeziora w Polsce należały do jezior oligotroficznych. Z biegiem czasu i pod wpływem środowiska przekształcały się w jeziora eutroficzne. Nieliczne zbiorniki oligotroficzne pozostały w Tatrach Wysokich. Na skutek działalności człowieka szybkości eutrofizacji na wielu jeziorach gwałtownie wzrosła. Nawozy sztuczne wypłukiwane z gleby, ścieki komunalne odprowadzane bezpośrednio do jezior, sprawiły bardzo niekorzystne zmiany w trofii wielu zbiorników. Głównym zagrożeniem są stosowane do nawożenia azotany i fosforany powodują one wzrost żyzności wody i szybki rozwój glonów. Duże ilości glonów ograniczają przezroczystość wody i nie przepuszczają promieni słonecznych. Ograniczona zostaje fotosynteza. Spada zawartość tlenu który jest zużywany przez drobnoustroje. Powstają deficyty tlenowe. Następuje zahamowanie procesów tlenowego rozkładu materii organicznej. Akumuluje się ona w dużych ilościach na dnie zbiornika, powodując jego wypłycanie i stopniowe zarastanie. W jeziorach o podwyższonej żyzności często dochodzi w okresie letnim do tzw. zakwitów glonów i sinic. Mają one niekorzystny wpływ na jakość wody i na organizmy żywe. Glony wydzielają toksyczne substancje które w końcu szkodzą im samym. Przede wszystkim są one zabójcze dla wielu gatunków ryb. Obumarłe glony również wydzielają szkodliwe substancje, zmieniają one smak i zapach wody. Stadium zaawansowanej eutrofizacji zbiornika oznacza jego szybki zanik. Im jezioro płytsze i mniejsze zarastanie postępuje szybciej. Problem przyspieszonej eutrofizacji dotyczy praktycznie tylko jezior. Rzeki są mniej zagrożone ponieważ następuje w nich intensywne mieszanie i natlenianie wody.
Jedynym rozwiązaniem spowalniającym proces eutrofizacji jest ograniczenie nawożenia oraz budowa większej ilości oczyszczalni ścieków.